2023 年 8 月，包括 Josep Carreras 研究所组长Eduard Porta 博士在内的研究团队发表了一项全面分析，分析了不同癌症类型中发现的癌症驱动因素变异的影响，从表观遗传失调到蛋白质-蛋白质相互作用。这项研究为癌症提供了更深入的视角，并为未来的临床研究提供了宝贵的数据。
在最近发表于著名科学杂志《癌细胞》上的一篇文章中，该联盟重点研究了最致命的癌症类型之一——高级别胶质瘤，并提供了迄今为止对这些细胞中发生的事情的最详细分析。高级别胶质瘤是一种侵袭性脑肿瘤，总体 5 年生存率低于 5%。
具体而言，研究团队集中研究了两种胶质瘤(胶质母细胞瘤和 IDH 突变 4 级星形细胞瘤)的肿瘤进展和复发的分子特征。他们从 200 多名患者身上采集了样本，提取了目前分子分析所能获得的几乎所有信息，如 DNA 测序、DNA 甲基化状态、RNA 表达、广泛的蛋白质组学分析和代谢状态。通过计算分析，团队随后探索了胶质瘤在各种生物背景下的分子特征，例如在存在特定突变的情况下或在肿瘤进展的情况下。
这项研究的优势之一是其中 53 个样本是纵向的，这意味着研究人员将同一患者原发性肿瘤的样本与治疗后复发后采集的另一个样本配对。这种设置提供了一个独特的机会来观察肿瘤在现实世界中是如何演变的。
结果表明，肿瘤进化使恶性细胞发生转变，降低了与细胞周期和 DNA 修复机制相关的基因表达。对更广泛的肿瘤微环境的分析也表明，复发性肿瘤存在差异，负责特殊功能的细胞类型(如组成血管的细胞)的贡献不同。该研究还以前所未有的精确度描述了与复发性疾病相关的特定遗传和表观遗传事件。
除此之外，分析的深度使我们能够彻底描述其他过程如何在肿瘤进展和复发中发挥作用，如反式效应(作用于远处分子物种的基因)、蛋白质翻译后修饰(如糖基化，能够破坏正常的蛋白质 - 蛋白质相互作用)和磷酸化(能够像开关一样激活或停用蛋白质)。
有趣的是，许多复发性肿瘤具有共同的分子特征。这些相似的特征为未来的研究提供了见解，其中一些可能最终成为预防胶质瘤患者疾病复发的有用临床靶点。
联盟提供的信息量将在未来几年成为许多其他研究人员的可靠来源。然而，作为先行者，他们指出了一组 13 个驱动基因在神经胶质瘤中发生了高度改变，并特别强调了 PTPN11 在 IDH 突变 4 级星形细胞瘤中的核心作用，这只是其中之一。
多组学(将遗传学、表观遗传学、蛋白质组学、代谢组学等融合在一起)的作用越来越重要，因为它有助于解释癌症进展中涉及的多个事件，这些事件太复杂了，无法仅从单一角度来理解。希望新药和新疗法也能随之出现。