R环失调会导致复制叉停滞和端粒不稳定。然而,R 环如何被识别和调节仍不清楚,特别是在端粒上。在这项研究中,研究人员使用邻近依赖性生物素识别(BioID)技术来鉴定ILF3相互作用组,并发现ILF3与包括DHX9在内的多种DNA/RNA解旋酶相互作用。这种相互作用表明ILF3可能促进端粒R环的解析,从而防止异常同源重组并维持端粒稳态。
该研究的主要发现包括:
ILF3 与端粒 R 环选择性相互作用,从而保护端粒免受异常同源重组。
ILF3 功能丧失会导致 TERRA 水平升高,引发端粒 R 环的积累。这种积累会诱导 DNA 损伤反应 (DDR) 和端粒功能障碍,其特征是 TIF 升高、端粒脆性和染色体外端粒片段的存在,这些片段可能反过来激活 ALT 通路。
此外,绘制 ILF3 相互作用组图揭示了与各种 DNA/RNA 解旋酶(包括 DHX9)的相互作用,这表明 ILF3 可能通过与 DHX9 的相互作用帮助解析端粒 R 环。
ILF3 可能充当端粒 R 环的读取器,有助于预防异常同源重组和维持端粒稳态。
这些结果支持ILF3与端粒RNA:DNA杂合结构(例如R环)相互作用,并通过RNA解旋酶DHX9促进R环的分解或抑制R环的过度积累。这项研究为端粒 R 环的调节和维持端粒稳态的机制提供了新的见解,对衰老生物学具有重要意义。题为“ ILF3protectstelomeresfrom aberranthomologousrecombinationasatelomericR-loopreader ”的论文发表在《Protein &Cell》上(发表于2023年11月22日)。