在一个充满奇幻色彩的小镇上，生活着一位热爱探索的年轻人——木鱼。他从小就对神秘的“世界神奇宝贝”充满了无尽的好奇与向往。传说中，这些神奇宝贝拥有改变世界的强大力量，但它们隐匿于世间，只有真正勇敢且纯洁的心灵才能找到它们。
一天清晨，木鱼在山间的小路上发现了一块奇异的石板，上面刻满了古老的符文。正当他研究时，石板突然散发出耀眼的光芒，并将他吸入了一个全新的维度。这里是一片漂浮的岛屿群，每座岛屿都孕育着一种独特的神奇宝贝。为了唤醒沉睡的力量，木鱼必须通过智慧和勇气解开一个个谜题。
在旅途中，木鱼遇到了一只受伤的小精灵，它自称是“风铃草精灵”。木鱼悉心照料它，渐渐地建立了深厚的友谊。小精灵告诉木鱼，只要集齐七颗“自然之心”，就能召唤出最终的神奇宝贝，为这个世界带来和平与希望。
木鱼决定踏上冒险之旅，用行动证明自己的决心。他相信，无论前方有多少困难，只要心中有爱，就一定能揭开“世界神奇宝贝”的秘密。